Hundens ID-märkning är det samma som numret på registreringsbeviset, men i stället för registreringsåret används en bokstavskod. Om hunden inte har ett registreringsbevis märks den med ett löpnummer.

I vissa sammanhang är det obligatoriskt med märkning. Det gäller för hundar vars höftleder undersöks med röntgen. Undersökningen görs på ett stort antal olika raser för att kontrollera om hunden har felutvecklade höftleder. Resultatet registreras hos Svenska kennelklubben.

När hunden ska märkas får den först en lugnande spruta av veterinären. ID-märkningen görs i vänster öra och utförs med tång. Innan märkningen rakas hunden i örat och tvättas med desinficerande medel. Själva märkningen går fort men gör ont just i märkningsögonblicket. Det är viktigt att djurägaren håller sin hund enligt personalens anvisningar under märkningsproceduren.

Efter att tången har tagits bort gnids extra färg in i örat som torkar på ca 15 minuter. Färgen ska inte tvättas bort utan flagnar av sig själv efter ungefär en vecka. Små svullnader kan uppstå efter typerna i tången, men de försvinner också efter någon vecka. Innan hunden får gå hem från kliniken läggs ett litet bandage på örat för att eventuell blödning ska stoppas.

Vid ID-märkning av katter tillämpar man samma teknik som för hundar. Enda skillnaden är att katterna måste få ett starkare lugnande medel eller sövas, eftersom de i regel inte är lika medgörliga som hundar.

Katten märks med en bokstavskod och ett löpnummer. I bokstavskoden ingår två bokstäver, en för länet där veterinären är verksam och en för kliniken. Katternas ID-register finns hos länsveterinären medan hundarnas finns hos Svenska kennelklubben.